Kaito Kid est de retour ! Le célèbre voleur magicien a prévu de réaliser un nouveau tour de magie exceptionnelle : dérober des pantoufles rarissimes devant une foule de téléspectateurs et la télévision. Par un tour incroyable de téléportation, il réussit et annonce devant les caméras de télévision qu'il récidivera le lendemain mais y arrivera t-il ?

Empoisonné par une organisation d'hommes en noir, Shinichi Kudo redevient un enfant et est contraint de retourner à l'école primaire. Tout en veillant à ce que le secret de sa nouvelle identité soit préservé, il mène des enquêtes et résout des affaires ténébreuses et autres meurtres inexpliqués.